聊城市人民检察院下辖东昌府区、临清、冠县、莘县、阳谷、东阿、茌平、高唐等8个县（市、区）检察院，市院机关下设办公室、政治部、侦查监督处、公诉一处、公诉二处、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、监所检察处、民事行政检察处、控告申诉检察处、职务犯罪预防处、检察技术处、法警支队、法律政策研究室、行政装备处、离退休干部处、机关党委、监察处、人民监督员办公室等19个内设机构。
        近年以来，全市检察机关有43个集体和81人（次）受到省级以上表彰，聊城市检察院被省委政法委授予“践行社会主义法治理念先进单位”，被省院荣记集体二等功一次，被市委、市政府评为“创人民满意先进单位”，连年被评为“市级文明单位”，市院反贪局被省委、省政府授予“人民满意的政法单位” 荣誉称号，市院控告申诉部门连续六届被评为“全国检察机关文明接待室”，连续两届被评为“全国检察机关文明接待示范窗口”。多次被评为“全国先进检察院”，全国优秀青年卫士等一大批先进典型。